Geneious
自动标注,实时序列分析和蛋白质结构预测
用我们全面的DNA序列编辑工具对您的序列充满信心。 编辑并注释序列,然后将您的作品导出为可发布的图像。
使用自动注释很容易发现
根据公共或本地数据库中的现有模式和注释自动注释新基因组,包括将ORF注释为基于这些模式和基于NCBI的查询的假设基因。
- 用ORF标注序列或用Glimmer预测基因
- 通过复制和粘贴序列搜索图案
- 基于相似性的注释(大型序列数据库)
- 使用对齐方式传输注释
- 用火卫一检测串联重复
强大的SNP检测和变异调用
在美丽的浏览器中导航读取。 在序列查看器中手动轻松识别,检查和解决分歧,或快速注释较大重叠群上的变异。 该功能可以配置为
- 通过查找高于最低阈值的分歧来屏幕读取错误。
- 仅在编码区域找到分歧
- 确定变异对蛋白质翻译的影响,包括仅密码子中第一个和第三个位置发生变化的变异
- 计算SNP正确的概率
- 消除高链偏倚的SNP
- 将您的变体导出到csv
- 搜索并注释短的结构变体,例如短串联重复序列(STR)和插入和删除事件(InDels)
实时序列预测
只需点击几下,您就可以找到您的序列,包括:
- DNA翻译 - 翻译和补充您的核苷酸序列。 一次翻译任何一帧或全部6帧,或者只是翻译您感兴趣的注释或选择。
- 共有序列 -根据您选择的身份方案,其中包括在其上会自动选择最佳的基地呼叫色谱数据“以质量求共识”预测一致序列
- DNA序列 - 预测身份,读取覆盖率,有关基本频率,残基频率,CpG岛等的众多统计数据
- 蛋白质序列 - 预测分子量,等电点,疏水性,跨膜区域,卷曲螺旋区域,氨基酸电荷等